流式細胞技術（Flow Cytometry,簡稱FCM）是一種高效的方法，用于分析和收集細胞懸液中的單個細胞。FCM的優勢在于其速度快、結果客觀，并且具有重要的統計意義。它能夠處理復雜的樣本，同時收集多個參數，其可靠性和重復性都非常出色。

今天我將總結并分享一系列關于流式細胞技術的常見問題及其分析。對于流式細胞術的原理和步驟不甚清晰的同學，建議先閱讀本公眾號以往的文章，了解背景知識。

1.熒光抗體染色無信號或信號弱

（1）加入的抗體量不足：這是普通的一種情況，只需要摸索實驗條件，適當增加抗體的量或濃度。

（2）細胞數量過多：熒光弱可能是因為細胞相對于染料太多了，應該正確地調整細胞的密度，一般低于1*10^7個/ml。

（3）抗體儲存方式不對：抗體沒有保存在4℃并且避光，比如冷凍（-20℃甚至更低）保存可能會導致熒光抗體的沉降，顯著影響抗體染色效果。

（4）用于細胞內染色的熒光染料分子量太大：染料體積太大，因此其進入細胞的可能性降低。

（5）一抗和二抗不相容：使用的二抗應與一抗的物種來源相同（例如，一抗為兔源，則應該使用抗兔源二抗）。

（6）儀器問題：（流式細胞儀的光學系統由三個部分組成：激光器、濾光片和檢測器。激光器的數量、檢測器的數量以及濾光器的類型共同決定儀器的檢測范圍）。這三部分之一出現問題的時候，就無法檢測到熒光信號。

如濾光片選擇有誤：不同熒光有不同的發射譜，為了檢測到信號，需要搭配能夠捕捉到該波長信號的濾光片（濾光片可以將熒光激發后產生的相應波長的光子引導至特定的傳感器上）；激光器沒有對齊：必要時通過運行液流檢查微珠來調整路線。

（7）靶蛋白不存在/表達水平低：巧婦難為無米之炊，要給靶蛋白染色，至少要確保組織/細胞類型表達的靶蛋白至少處于足夠檢測的量。

（8）靶蛋白存在于細胞表面還是細胞內：有些抗原表達在細胞表面，有些表達在胞漿、細胞器內、胞核，甚至有些在所有部位都表達。比如對細胞系進行染色時，胰蛋白酶通常可以引起細胞表面蛋白的內化，因此需要確定好抗原的表達位置，選擇合適的染色方法。

（9）靶蛋白的表達需要經過誘導：有些抗原在活化后發生下調，而有些蛋白則需要被誘導才能表達。因此要選擇合適的方法激活細胞，使其充分表達靶蛋白，同時要加蛋白轉運抑制劑使其留在胞內，然后固定破膜，染相應抗體。

（10）靶蛋白是分泌蛋白：分泌蛋白的檢測十分困難，因為蛋白會在檢測前從細胞中釋放出來且可能快速降解。高爾基體阻斷劑（如布雷非德菌素A）可用于抑制表達蛋白的分泌，使其仍保留在高爾基體中。然后再用細胞內染色法檢測靶標蛋白。

（11）補償過高：使用陽性對照再次正確設置流式細胞儀

2.熒光強度過高

（1）抗體濃度過高：這將會導致非常明顯的非特異性結合或者是特異性結合的高強度熒光。

（2）過多抗體被捕獲于細胞內：在胞內染色的時候，較大的熒光分子被困在細胞內部。

（3）封閉不足：封閉這個操作可以有效地減少染料和蛋白的非特異性結合。

3.在應該只有一個細胞群的情況下觀察到多個細胞群

（1）樣品本身含有多個表達靶蛋白的細胞群：有可能是因為表達該靶蛋白的細胞群不止一個，但操作過程中沒有做好分離。

（2）出現細胞雙峰：出現了第一群兩倍熒光強度的第二群細胞。可能是細胞分離不充分甚至是細胞團塊沒有過濾掉，導致檢測時多個細胞聚集在一起。

4.儀器檢測到的粒子太少

(這里的粒子指的是上樣時儀器檢測到的微粒，有可能是細胞，也有可能是破碎細胞產生的細胞器，或者沒有充分分離而形成的細胞團塊）

（1）細胞密度低：即每毫升樣品的細胞數目太少，自然檢測的效率就不高。

（2）檢測的參數當中電壓設置得太低。

（3）細胞聚集，堵塞管道：多個細胞聚集成團快，卻被檢測成一個粒子，且該粒子大小是異常的，在后續圈門也有可能被廢棄。染色前要輕輕吹打幾次，確保形成單細胞懸液，上樣之前最好再次混勻。另外，染細胞死活對于這一問題也有幫助，因為死細胞會釋放它的DNA，而DNA非常粘稠，最后會導致細胞成團。

5.背景高或陽性細胞百分比高

（1）抗體過量。

（2）補償過低：流式細胞分析中經常要用到2種以上的熒光標記抗體進行染色，而目前所使用的多種熒光染料發射譜間有一定重疊，也就是說，熒光A的激發光會有一部分被熒光B的通道檢測到，這就是熒光溢漏。例如，當我們在進行單色流式實驗的時候，可以在其他通道砍到熒光信號，這些熒光信號就是溢漏出來的熒光，而糾正熒光溢漏的過程就是“補償"。補償太低，就無法正確地糾正這些溢漏的熒光信號，使背景變高。

6.側向散射（反映細胞的顆粒度）背景高

（1）細胞裂解過度：制備樣品時離心或振蕩過度，使細胞破碎產生細胞碎片。

（2）細菌污染：從其它微小顆粒和背景信號中區分細菌群落的方法是用熒光染料標記細菌，然后使用該熒光來識別目標群落。

（3）死細胞的處理：流式細胞術非常容易被死細胞干擾，因為死細胞比活細胞更容易攝取抗體和探針，導致明顯的非特異性染色。且死細胞的自發熒光往往特別強，這樣背景熒光變強，就無法觀察到一些靶蛋白的弱陽性表達了。

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